沖縄本島中南部は低平です。高い所でも海抜100mから150m程度です。ほとんどが市街地や耕作地などとして利用されています。所々わずかに木々が生えているだけです。市街地でもヌマガエル、オキナワアオガエル、リュウキュウカジカガエル、ヒメアマガエルが生息しています。

南部の御嶽（うたき）林の窪地に雨水が溜まった池、南部の大きな湧水地です。池周辺にはオキナワアオガエル、ヒメアマガエル、水が流れている遊水池ではリュウキュウカジカガエルなどが見られます。沖縄島の中南部に残っている緑地はあまり多くありません。大きな公園、河岸の崖、急斜面、御嶽、城跡などに残された程度です。

人が利用しやすいように手が加えられた湧水です。リュウキュウカジカガエルや、水が溜まった場所ではヒメアマガエルなどが見られます。

水田と耕作地に設けられた沈砂地です。水田ではヌマガエル、リュキュウカジカガエル、シロアゴガエル、ヒメアマガエルなどが見られます。沈砂地ではヒメアマガエル、シロアゴガエルのほかウシガエルが生息する事もあります。

耕作地や民家の庭に置かれた容器に溜まった水でシロアゴガエルやヒメアマガエルが繁殖する事があります。排水口の集水マスでもヒメアマガエルやシロアゴガエルが繁殖する事があります。

市街地の側溝の排水でリュウキュウカジカガエルが繁殖する事もあります。建物周辺の側溝に雨水が溜まった場所でヒメアマガエルが繁殖する事もあります。

北部の森林はやんばる国立公園に指定されています。また2021年に奄美大島、徳之島、西表島の森と共に世界自然遺産登録が決定しました。山地の谷は渓流となっており、渓流周辺に生息するリュウキュウアカガエル、オキナワイシカワガエル、ハナサキガエル、ホルストガエル、ナミエガエルが生息しています。

山地の谷部を流れる渓流です。リュウキュウアカガエル、オキナワイシカワガエル、ハナサキガエル、ホルストガエル、ナミエガエルが生息しています。また市街地も生息するオキナワアオガエル、リュウキュウカジカガエル、ヒメアマガエルも生息しています。

こちらも山地の谷部を流れる渓流です。滝の周辺ではよくオキナワイシカワガエルが見られます。また滝壺や渓流の淵ではハナサキガエルが産卵を行います。

谷の渓流が堰き止められ池状になった場所です。ハロウェルアマガエルやホルストガエル、オキナワアオガエルなどが見られます。場所によっては外来種のシロアゴガエルとウシガエルが侵入している事もあります。

渓流の源流部で、狭い谷間の底部に泥が溜まり田んぼのような湿地になった場所と、源流の一部が池状になった場所です。リュキュウアカガエル、ホルストガエル、オキナワアオガエル、ヒメアマガエル、リュウキュウカジカガエルなどが繁殖します。

石垣島と西表島の山地森林です。西表石垣国立公園に指定されています。また2021年、奄美大島、徳之島、やんばるの森と共に世界自然遺産登録が決定しました。

山地森林の谷部を流れる渓流と、木のうろに溜まった水です。渓流周辺にはオオハナサキガエルやコガタハナサキガエルが生息しています。森の木のうろに溜まった水ではアイフィンガーガエルが繁殖します。

森の中に砂泥がたまり田んぼのような湿地になった場所があります。砂泥地ではヤエヤマハラブチガエルが繁殖します。流れのある場所ではオオハナサキガエル、ヤエヤマカジカガエルが繁殖する事もあります。流れが滞って池状になった場所ではヤエヤマアオガエル、ヤエヤマヒメアマガエルが繁殖します。

水田と小さな流れを石積みで堰き止めた場所です。平地の水辺ではサキシマヌマガエル、ヤエヤマアオガエル、ヤエヤマカジカガエル、ヤエヤマヒメアマガエルなどが繁殖します。石垣島では水田などで外来種のオオヒキガエルが繁殖している事もあります。

宮古島は最も海抜が高い場所で113ｍ。低平な地形の島で山地がなく大きな河川もありません。耕作地が多く森林面積は少ない島です。残された森林内の池などでミヤコヒキガエルやヒメアマガエルなどが繁殖します。小規模な河川の河口が閉塞し池状になった場所でもミヤコヒキガエルが繁殖します。